Несмотря на то, что в разделе "Действия при обнаружении занятых файлов" у меня выключена опция "Показать диалог" и выбрано "Пропустить", сообщение всё равно каждый раз выскакивает: что делать с таким-то файлом, бла-бла-бла. Да, оно отключается через сколько-то там секунд, 30 что ли... но всё равно достаёт.
Я-то решил проблему... поскольку в моём случае это всегда темп-файлы одной и той же программы, с одним и тем же расширением, я просто исключил их по маске. Но тем не менее, проблема существует.